結論だけ先に
ヘッダー、フッター、ページ番号、透かしはどれも各ページに情報を足しますが、解決する課題は違います。違う用途を同じ方法で無理に済ませると、見づらいか、伝わりにくい文書になりがちです。
ガイド
どれも PDF ページに追加情報を見せる機能ですが、目的は異なります。違いを理解すると、必要な編集フローを選びやすくなります。
ヘッダー、フッター、ページ番号、透かしはどれも各ページに情報を足しますが、解決する課題は違います。違う用途を同じ方法で無理に済ませると、見づらいか、伝わりにくい文書になりがちです。
各ページに何かを入れたいが、番号を振るべきか、端に注記を置くべきか、本文上に大きく状態表示を重ねるべきかで迷うことが多いです。欲しいのは「毎ページ何かを出すこと」ではなく、「何をどう伝えるか」です。
ヘッダーやフッターは、各ページの上端または下端に同じ短いテキストを置く方法です。文書状態、機密区分、版管理、配布条件、内部参照番号などに向いています。
見た目は似ていても、ページ番号はページごとに値が変わるため別機能です。現在ページ、総ページ数、左右位置、開始番号などの制御が必要になりやすいです。
透かしは端ではなく本文上に重ねることが多く、Draft、Confidential、Sample、社外秘のような状態表示を強く見せたいときに向いています。部分表示やスクリーンショットでも目に入りやすいのが利点です。
端の短い固定注記ならヘッダー・フッター、参照や順序づけならページ番号、本文上に強く見せたい状態表示なら透かし、という整理で考えると選びやすくなります。
法務文書には参照しやすいページ番号、研修資料にはチーム名のフッター、レビュー版には Draft の透かし、というように、同じ「毎ページ表示」でも最適解は違います。
ページ番号を固定フッターで代用しようとする、端の小さな注記で十分なのに透かしを使う、余白が少ない場所にヘッダーを置いて本文と重ねる、といった失敗が起きます。名前の似ている機能ではなく、伝えたい内容で選ぶことが重要です。
PDFヘッダー・フッター追加 は固定注記、PDFページ番号追加 は採番、PDF透かし追加 は強いオーバーレイに向いています。どれも文書全体の再設計をする道具ではなく、プレビュー確認は前提です。
ページ番号はフッターで代用できるのか、機密表示は透かしのほうがよいのか、端に置くべきか本文上に重ねるべきか、といった疑問がよくあります。端の繰り返し表示なら PDFヘッダー・フッター追加、採番なら PDFページ番号追加、強いオーバーレイなら PDF透かし追加、処理方式の理解には ブラウザ内PDFツールとプライバシー を参照してください。